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从整合素共激活蛋白Kindlin-2的降解机制看基于分子机制的实验设计
来源: 时间:2019-02-27 13:50:50
摘要:第十一届乳腺疾病泉城论坛讲课荟萃之北京大学 张宏权教授 从整合素共激活蛋白Kindlin-2的降解机制看基于分子机制的实验设计
讲者:张宏权
单位:北京大学基础医学院 北京大学肿瘤研究中心 北京大学天然药物与仿生药物国家重点实验室PI
地点:济南绿地美利亚酒店
场次:第一节 甲冠天下
主持:郝秀原
嘉宾:徐莹莹、于志勇、贾国丛、李云涛、张聚良、曹亚丽、徐玲
张宏权教授分享了他在日常科研工作中的研究思路,希望能够对大家的科研工作起到一定帮助。
众所周知,转移是造成90%以上的恶性肿瘤死亡的主要原因,主要转移器官可有脑、骨、肺、淋巴结和肝脏等。从分子生物学角度,肿瘤的转移是一种生物学行为,是多步骤的过程,整合素在其中发挥重要调节功能。我们的实验室对整合素及相关分子通路进行了20余年的研究,最终找到了一些新的作用分子。
整合素的基本结构包括胞外结构域、跨膜结构域以及胞内结构域,其主要发挥作用的部位在于胞内结构域,通过蛋白质之间的相互作用实现。在特定、靶向的转移都由整合素介导,并且整合素的激活能够调控下游其他重要的信号通路,对胚胎发育,甚至生命的正常运行都起到重要的作用。这一选题也给我们科研思路带来启示,选题必须要具有高度的研究以及临床意义。
整合素可由非激活转变为激活状态,从而聚集并通过胞外受体介导,为分子提供了相互作用的场所。我们将关注点放在整合素的激活,最终发现了kindlin家族。Kindlin家族共有三类分子,我们主要关注点在kindlin-2,其在一系列疾病中都起到重要的作用,也对心脏、胚胎发育及植入、骨骼形成具有重要意义。
关于kindlin-2,我们提出了问题:Kindlin-2 蛋白是如何降解的?以及降解的分子机制是什么?
我们知道,蛋白质的降解有泛素-蛋白酶体介导的蛋白质降解,溶酶体降解途径,自噬途径以及Sumo-E3等途径。最终我们确定,kindlin-2的降解途径为泛素-蛋白酶体介导的蛋白质降解,下一步是确认具体降解因子,我们根据查阅大量文献,发现细胞间的黏附结构中存在分子smurf1,经过进一步查阅线索,我们最终发现,smurf1可介导talin的降解,而talin恰好与kindlin-2共同介导整合素的激活,于是我们确定了smurf1作为研究对象。
我们进行了大量的实验,进行分子机制的研究,在多种细胞中,如CHO细胞、成纤维细胞、足状突细胞、Hela细胞及不同乳腺癌细胞进行了实验验证,实验结果显示,在多种细胞中,smurf1能够通过缩短kindlin-2的半衰期,抑制αIIbβ整合素的激活。通过大量的质谱分析,我们找出11个kindlin-2潜在的降解位点,并对每个位点进行机制以及基因突变的生化实验,找出与泛素结合的氨基酸位点。下一部分为二者的相互作用,应找出有哪些特定结构域或特定的氨基酸相互作用,进行了大量功能方面的研究,如细胞延展、运动及粘附等。最终是疾病相关的研究,在动物实验中进行了大量的相关性研究,最终发现,敲除smurf1位点后,kindlin-2累积量增多,在分子、细胞、组织以及实验动物、患者个体层面进行分析,皆证实,二者的关系呈负相关性。最终我们将结果发表在general cell biology。
以上就是我们研究的思路,希望能够给大家带来一定启发。
视频链接:https://v.qq.com/x/page/l0831fgt5gr.html
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